文献检索技巧——文献管理与文献信息分析-图书文献

8/21/2018

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1885

8/21/2018 12:00:00 AM

 
《文献管理与文献信息分析》罗昭锋
作者序:
    决定编写此书是缘于几年来的Endnote推广工作以及去年编写的一本小册子。去年国庆期间编写了《Endnote X中文使用手册(试用版)》,10 月8 日发布在校园网上,当初希望通过校内读者的反馈进行修订之后再向外发布,后来由于种种原因,未能及时进行修改,而这本小册子也被转到了国内多个论坛上,逐渐开始在网上传播开来。
    在过去的这一年中,收到大量的信件,有提出建议的、有请教问题的,还有很多就是为了表示致谢和鼓励的。记得有位老师说,他们单位给每位老师印发了一本。这些信件给了我莫大的鼓励和安慰,非常感谢各位网友的支持。没有你们的支持、鼓励和期待,我很难下舍下手头的实验来编写此书。 
    信息是一个人得以生存的基础。创新实际上是我们种到头脑中的种子开花之后结出的果实。没有输入信息的头脑,好比没有洒下种子的土地。不管土地有多肥沃,也结不出丰硕的果实。我曾考虑过一个问题,为什么现在的孩子比多年前的孩子要聪明;同时代而言,城市里同龄的孩子要比农村里的孩子聪明。我觉得关键就是他们 接触的信息量不同。俗话说,种瓜得瓜,种豆得豆。要想我们的大脑结出丰硕的果实,就要种下大量而且饱满的种子。对科研工作者而言,这些种子就是文献信息。 我们播种的信息决定了结出果实的质量。任何人的创新都是在前人的基础之上。科学工作者如果不能掌握前人已有的工作基础,所谓的“创造”不过是闭门造车而 已。中国有过太多这样鲜活的实例。全面掌握前人的工作,就如同站到了巨人的肩膀上。 
    对于一个科研工作者来说,关于文献信息我觉得要掌握三方面的能力:一是文献信息的获取能力;二是文献信息管理能力;三是文献信息分析和利用的能力。 文献信息的获取能力相对来说比较容易,大致说来有以下一些途径:(1 )综合性数据库(Web of Science, Pubmed 等),(2 )专题数据库(Gene Bank,蛋白质结构数据库,  分子相互作用数据库,  化学反应数据库等),(3 )专利数据库,(4 )会议论文数据库,(5)学位论文数据库,(6 )综合搜索引擎,(7)咨询和交流,(8 )公司的网站及产品技术手册。 文献信息管理能力在网络时代才变得复杂。多年前,我们只能获得很少量的信息,一般通过记录本或者记录卡就可以进行管理。如今每个人都可以获得大量的信息, 管理就显得重要起来。本书中推荐大家利用 Endnote进行文献管理。它可以帮助你进行全文管理和笔记管理等,便于大家进行检索和分析。提供一些杂志的全文模板,同时可以自动帮你编排参考文献信 息。 
    文献信息分析是在文献多到无法阅读的时候才显得重要的。如今随便用一个关键词就可以找到成千上万篇文献,我们不可能把这些文献一一阅读一遍,因此就要求我 们能够从这些文献中找出最相关的信息来。过去我们习惯不断限制检索条件,将文献数限制在有能力阅读的范围内。如今通过本书,我们为你提供了一套更好的解决 方案,那就是利用文献信息分析软件,它们能够帮你在短时间内把握大量文献的主旨信息。本书介绍的RefViz 和Quosa 就属于这类软件。 
    作者真诚希望本书能帮你提高驾驭文献信息的能力,让你真正站到巨人的肩膀上。为自己的大脑种下优质的种子。 如果你想在Nature 或者Science上发表论文,首先就得学习 Nature 或者Science上别人所做的工作。如果我们每天只阅读那些下三滥的论文,决不会想出奇妙的点子,做出惊人的创新来的。 
    要创造就要给大脑输入有用的信息。面对浩瀚的信息,如何快速找到最相关的信息,如何发现这些信息之间的相互关联,正是本书想为你解决的问题。 本书介绍的三大软件,Endnote 将教你如何管理数以万计的文献,如何管理全文,如何管理阅读笔记,以及如何利用Endnote来撰写论文,编排参考文献等。RefViz 是一个文本信息分析软件,可以根据文献标题和摘要信息进行文献分类,并指出文献间相互关系。熟练掌握这个软件,你将会轻松驾驭海量的文献信息,快速获取最 重要的信息,为 你提供不竭的创新思路。 Quosa 是一款全文分析软件,可以自动下载全文,并对全文进行分析,还可以提取已下载的pdf 中的引文信息。 
    综合利用以上三个软件,基本可以满足你对文献分析与管理的需求。 这本书不同于去年编写的手册。首先从内容上要丰富很多,去年的手册仅包括本书中第一部分的内容。此书中增加了Endnote  高级功能部分和常见问题解答。Refviz 和Quosa 两个软件也是新增的内容。从编写的目的来看也是大不相同,去年只是满足于让大家学会使用Endnote,此书更希望为科研工作者的文献管理与分析工作提供 一套解决方案。另外,此书还是集体智慧和经验的总结,避免了个人思路的局限,使其更具参考价值。 参与编写的共有六人,分别是:文献管理版的版主,远在美国求学的王研,参考我去年的手册,编写了本书的第一部分;南京农业大学博士研究生韩敏义编写了 Endnote高级功能部分的第四至第七章,其中很多是我所不熟悉的,使我获益良多;夏春智(山东大学博士研究生)、田二坡(汕头大学医学院研究生)和陈 飞(重庆大学)三位编写了常见问题解答部分,他们分别搜集了我们的论坛、Endnote网站、以及 QQ群众常见的问题,并一一给出了解决方案,具有重要的参考价值。一般新手碰到的常见问题都给予了很好的解决方案。我参与编写了高级功能部分中的主题列表 和Endnote Web 部分,以及 RefViz 和Quosa 两个软件的介绍。RefViz 和Quosa 这两个软件目前国内应用的较少,很难找到有价值的参考资料。因此只好翻阅原版说明书,为此打印了RefViz 说明书的全部内容,阅读过不止一遍,仍有很多地方不是很清楚。这个软件其实并不难学,难在灵活应用上,难在通过软件获得自己想要的信息。这部分内容书中只 能通过举例来加以说明,读者只有通过不断练习和揣摩才能熟练掌握。Quosa 是最近才开始学习的软件,尽管很不熟悉,但很多功能很重要也很实用,一并予以介绍,希望对大家入门起到一点指导作用。 去写这些不太熟悉的内容是需要勇气的,总担心有误人子弟之嫌。好在此书读者都是高级知识分子,能够识别出一些显而易见的错误,才让我免了一份顾虑。在此真 诚地恳请各位读者如果发现书中有什么错误请一一指出,我们会将发现的错误更正信息发布在论坛上,并且如果有机会在进行改进的话一一予以更正。反馈的方式可 以给我发送  email(
smilesun@ustc.edu ),或者将相关内容发布在论坛上(http://biotech.ustc.edu.cn/forum 文献管理版)。如果你在文献管理和信息分析方面有好的经验,也希望你能发布到我们的论坛上,让更多人分享你的经验。 
    关于本书的版权,如同我去年编写的手册,只要不用于商业目的,欢迎任何形式的传播和转载,希望尽量保持原始文件的真实性。 
    在本书编写过程中,我们参考了一些网络资源,如在编写常见问题解答部分,参考了中科院植物研究所综合办公室周凌娟编写的《Endnote使用FAQ 》。在我最初学习RefViz 时,丁香园中一位网友写的《文献分析软件RefViz 点点通》给我了一些帮助。还有些未能一一指出的,在此一并向原作者致敬。 
    非常感谢各位网友给予我的鼓励,你们让我认识到这项工作的价值,让我愿意继续为此而努力。感谢参与编写本书的各位“战友”,尽管我们彼此素不相识,但几位 战友都是经验丰富的热心人士,在 QQ群以及论坛上,为各位新手排忧解难。他们无私的奉献,为我们搭建了一个交流的平台。感谢你们无私的付出,没有你们的付出,就不会有本书的面世。 
    我还要特别感谢我的妻子,她对我的倾力支持,以及她对我生活的悉心照顾,才使我能忙里偷闲来撰写这些文字。 
罗昭锋 
于中国科学技术大学 
2007-11-25 
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